Windows Updateでいきなり再起動されてデータが消えたって話は未だによく聞くので自動的に再起動を防止する方法のメモ

Business以降のグレードならだったらグループポリシーを使えば設定できる
Homeとかpremiumはないのでレジストリを直接変更する必要がある。

レジストリを直接変更するのは面倒だと思うので、Prevent Windows Update from Forcibly Rebooting Your Computer – How-To Geekに置いてあるregまたはオンオフがGUIでできるソフトウェアを使うと楽です。

自動更新のダイアログが出ているときに、そのダイアログを黙らせるだけなら(防止はできない)
誠 Biz.ID:3分LifeHacking:「今すぐ再起動しますか?」のダイアログを“マホトーン”するで紹介されている、
XP にマホトーンをとなえるを使うといい。

もっと汎用的にWindows Update以外のソフトウェアによる再起動を防止したいのならShutdownGuardを利用するとその都度確認を取ってからシャットダウン・再起動・ログオフを行える。
追記:同様の事が「ちょっと待った」でも行える

ソフトウェアのリンクまとめ